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去掉基因中的“无用”片段,细胞还能活吗?这个实验出人意料

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如果把细胞中的遗传信息比作一本书,那么在真核细胞的这本书里,用来指导蛋白质合成的信息并不连续,而是夹杂着大量看似多余的段落。当真核细胞通过“阅读”基因来制造蛋白质时,需精准删除这些段落,才能拼出真正有用的信息。这些被删掉的片段叫内含子,而负责剪切的分子机器叫剪接体。

长期以来,一个困惑始终萦绕在科学家心头:既然内含子的信息会被跳过,那它还是不可缺少的吗?真核细胞离了内含子和剪接体,还能不能存活?2026年7月,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心的研究团队在《细胞》杂志上发表了一项重磅研究,给出了出人意料的答案。



从基因到蛋白:

细胞里的剪辑工程

要理解这项研究的意义,得先了解真核生物是怎么制造蛋白质的。

细胞的遗传信息存储在细胞核的DNA里,但其中的有效信息并不连续。在一个基因中,编码蛋白质的序列被称为外显子,它们被不编码蛋白质的内含子隔开了。真核生物中蛋白编码的过程,首先是以整段基因为模板,转录合成前体RNA,再由剪接体把内含子精准切除、把外显子连接起来,得到成熟的mRNA,mRNA最终在核糖体上被翻译成蛋白质。

这个过程有点像拍电影:导演拍了很多素材,后期剪辑师把废镜头剪掉,把好镜头拼接成最终成片,才能上映。剪接体便是真核细胞内优秀的剪辑师。

从酵母到人类,几乎所有真核生物都具有内含子和剪接体。在人类基因组中,平均每个基因具有8个内含子,剪接体的异常更是会导致数十种遗传病。正因如此,学界长期默认内含子与剪接体是真核生物的标配,是维持细胞存活必不可少的元件。

但这个结论始终停留在猜想层面。既往研究中,单个内含子的删除往往不致命,但如果把一个细胞里所有内含子全部清空,细胞究竟是生是死?这个问题的答案,尚无人知晓。

六年磨一剑:

“分头拼装”造出无内含子细胞

为了回答这个问题,研究团队盯上了酿酒酵母。这是一种只有约300个内含子的单细胞真核生物,与庞大的人类基因组相比,酿酒酵母称得上是一本“薄书”。但即便如此,逐个敲掉内含子也是项浩大工程,如果使用传统方法,至少需要12年。

为此,研究团队设计了一套“分头施工、重组拼装”的策略。简单来说,酵母有两种存在状态:只有一套染色体的单倍体,和携带两套染色体的二倍体。单倍体就像独立的施工小队,能分别删除内含子。当两种不同交配型的单倍体结合形成二倍体,两套同源染色体就有了交换重组的可能。



科学家将内含子分成数十组,在不同单倍体酵母中分别进行删除。随后通过交配获得二倍体细胞,再诱导染色体重组,将删除不同内含子的基因片段整合到同一条染色体上。最后诱导二倍体减数分裂,从而筛选出删除更多内含子的单倍体后代

这一设计利用了二倍体生物的核心优势:两套基因组既互为备份,大幅提升遗传容错能力;又能通过重组快速组合不同的遗传变异,加速性状整合(人类作为二倍体生物,也是以此为基础,通过精子和卵子的结合实现遗传多样性的)。以此方式,研究团队得以将原本需要12年的工程,压缩到了6年。

最终诞生的菌株被命名为SYNE27α。在它的基因组中,内含子全部被精准移除,但菌株存活不受影响。研究人员进一步敲除了剪接体的多个核心组分,包括全部5种关键核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6),以及Prp8、Prp9等剪接体核心蛋白。这些在正常细胞中绝对致命的操作,在SYNE27α中竟然没有影响细胞存活

这一结果清晰地证明:没有内含子的真核细胞可以不依赖剪接体功能而生存,剪接体的必需性,本质上只来源于切除内含子的需求。



当然,彻底失去内含子的真核生物也付出了代价。无内含子酵母的生长速度明显减慢,细胞倍增时间从109分钟延长至217分钟。分析显示,这种生长缺陷主要源于核糖体生物合成的紊乱。许多编码核糖体蛋白的基因依赖内含子实现表达自调控,内含子缺失后,核糖体组装效率下降,造成蛋白质合成速率整体放缓。

值得注意的是,这种生长缺陷是一种隐性性状。也就是说,如果让无内含子酵母与正常酵母交配,形成的杂合二倍体的生长状态与野生型无异。这再次印证了二倍体生物的强大容错能力——一份正常的等位基因,就足以弥补全部缺陷。

内含子:

虽非必须,但并非无用

这项研究回答了一个困扰生物学界数十年的问题:内含子和剪接体并非真核细胞存活所必需。

但这绝不意味着内含子完全无用。实际上,内含子在演化中被保留下来,恰恰因为它们提供了重要的调控功能,例如影响基因表达水平、帮助应对环境压力,以及参与核糖体组装的精细调控,起到“油门”和“刹车”的作用。

这也解释了为什么在亿万年的演化中,真核生物选择了保留内含子。它不是活命的底线,却是提升生存竞争力的重要筹码。

这项研究的意义远不止回答一个基础问题。这株酵母就像一张干净的空白画布,提供了一个零内含子的干净背景,让科学家可以逐一放回单个内含子,精准解析它们的功能。它为探索内含子的起源与演化提供了全新的实验平台,也为未来合成最小真核基因组指明了方向。

生命从来没有唯一的标准答案。从单染色体到无内含子酵母,我们一次次打破对生命标配的认知,也一步步逼近真核基因组演化的底层逻辑。这株小小的酵母,蕴藏着真核生物演化的秘密,也将成为未来合成生物学的重要基石。

策划制作

作者丨李静慧 上海交通大学医学院附属瑞金医院

审核丨陶宁 生物医学领域专家 研究员

策划丨江帆 高佩雯

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