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2026年10月6日，Nature Communications在线发表题为《Genetically engineered RNA inducers of proximity for protein regulation》的研究。CRISPR-Cas9和RNAi多在DNA或RNA层面调控蛋白表达，直接操控蛋白的遗传工程策略仍少，小分子邻近诱导技术受可成药位点限制。中国科学院杭州医学研究所方晓红、周卫团队开发了GENRIP，这种遗传编码RNA邻近诱导平台用两个RNA基序分别识别目标蛋白和效应酶，把效应酶拉到目标蛋白附近，完成翻译后修饰并改变蛋白命运。
研究团队选用RNA结合E3泛素连接酶MEX3A和RNA结合激酶CamK作为效应模块，验证了泛素化降解与磷酸化激活两条路径。RNA-AQ能同时结合MEX3A和QKI，形成稳定三元复合物并缩短两者空间距离，QKI蛋白水平随时间与剂量下降，QKI和MEX3A的RNA水平没有明显变化。敲低MEX3A或用MG132处理后，降解效应减弱，CQ不能逆转，免疫沉淀显示QKI泛素化增加。RNA-AQ在SKOV3、PC9、PANC1和4T1等细胞中也能降低QKI，换用MDM2的RNA-MQ同样有效。
在蛋白激活方面，RNA-GC把CamK招募到GFP-Tau附近，增强Tau磷酸化。免疫沉淀质谱检测到20个Tau磷酸化位点，RNA-GC处理后这些位点水平升高，S673位点磷酸化增加，Tau蛋白聚集颗粒也增多。研究团队还测试了可编程性，连接子长度从2 nt到50 nt都能工作，2到10 nt活性较高；RNA-AQ有降解活性，RNA-QA活性很低，增加MEX3A结合模块可恢复部分活性。借助RNA二级结构预测，他们能优化基序折叠，并且用Tau适配体构建RNA-AT，把靶标扩展到非RNA结合蛋白，RNA-TAQ还能同时降低QKI和Tau。
GENRIP还能借助启动子实现空间和细胞类型选择，TBG启动子驱动RNA-AQ在LO2肝细胞中降低QKI，对293T细胞影响较小，U6启动子转录的RNA-AQ更偏向降解核内蛋白，CMV启动子转录的RNA-AQ更偏向降解胞质蛋白。在KYSE150细胞中，RNA-AQ降低细胞活力、减少克隆形成并增加凋亡。腺病毒递送AV-AQ和脂质体递送体外转录RNA-AQ都抑制小鼠皮下肿瘤生长，肿瘤内QKI蛋白下降23.4%，小鼠体重没有明显变化。该平台把遗传工程从DNA和RNA层面推进到蛋白层面，为蛋白功能研究、合成生物学和肿瘤治疗提供了新工具。
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