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一条好鱼,为啥要成为药企标配?

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如果看论文数量,斑马鱼早就算不什么新模型了。

体长几厘米的小鱼已被广泛用于发育生物学等领域的研究,甚至出现在了真正的药物发现流程里。


受精4、5天后就可发育出跳动的心脏、功能性肝脏和成形的大脑;很多心血管、神经行为和毒理实验一周内就可以拿到数据;

这种兼具低成本、高通量、完整脊椎动物生理系统,还能做活体成像的动物模型,按理非常符合药企胃口。

但实际上斑马鱼不像小鼠那样成为默认选项,只出现在某些特定课题、疾病模型或者科研合作里。

PART 01

真正价值在细胞和小鼠之间

理解斑马鱼先别急和小鼠比较。

药物研发各种模型的底层逻辑是用低成本的实验体系,尽可能提前判断候选药物在更复杂系统里的表现。

早期体外模型快且通量高。


一个蛋白、一个细胞系、几块板子很快淘汰大量没活性的分子。随着类器官等技术的发展,体外模型越来越复杂,但再复杂也不能完整反映药物进入机体后的组织分布、器官相互作用等问题。

这些问题只能留给小鼠模型,但代价是成本、周期和通量!

斑马鱼恰好处在体外模型和小鼠模型之间。

它是一种脊椎动物,拥有心血管、肝脏、肾脏和神经系统;成熟斑马鱼每周可产生数百枚同步胚胎,幼鱼可以放到标准96孔板研究观察。

已经有报道在自动化较好的平台上,每周可测试数千到上万个化合物,而同样时间下小鼠活体筛选只能完成几十个。

因此,斑马鱼可以理解为体外细胞体系和复杂哺乳动物模型间的桥梁。


PART 02

优势鲜明

传统药筛先看能不能结合靶点,再看细胞活性,然后做药代、毒理和动物药效。

斑马鱼提供了另外一种研究思路。

由于胚胎和幼体透明,研究人员可以直接观察心脏搏动、血流、血管生成、肿瘤迁移、神经元变化等过程;再加上行为学记录,还能分析运动轨迹、刺激反应和癫痫样行为。

通过多孔板培养,先记录整体表型,筛出有反应的化合物,再回头找具体靶点。

从疾病表型出发,去找能改变表型的药物,这和靶点导向的药物发现有很大区别。


Dravet综合征是比较有代表性的案例。

scn1Lab突变斑马鱼会出现自发癫痫放电和异常游泳行为,研究人员基于这一表型筛选数百种药物,找到了能抑制癫痫样行为的clemizole,之后进入临床。

PART 03

体内进行构效设计

传统药物设计依赖体外模型来断优化分子结构。

改一个基团在看酶活或细胞活性变化,再平衡选择性、溶解度和药代性质,最后挑出少量分子进入动物。

但体外体系有自身局限。

受体可能处于过表达状态,膜环境和真实组织不同;很多体系缺乏完整代谢能力,没有真正的组织背景和补偿性信号。

因此很多体外测试表现好的药物,进入动物后就被淘汰了~


斑马鱼模型可以把构效关系优化放到体内完成。

Dorsomorphin在斑马鱼里可以同时抑制ALK2和VEGFR2抑制。研究人员不断合成类似物,再观察两种表型如何随结构而变化,最后分别得到选择性ALK2抑制剂DMH1和VEGF通路抑制剂DMH4。

这类工作有很现实的价值,把部分动物阶段才会暴露的问题提前到先导化合物优化阶段。

PART 04

为什么还不是标配?

问题也从这里开始,药企对实验模型的要求和科研不同。

在药企,模型的成立是必须影响药物筛选决策。阳性结果能提高后续老鼠实验成功率,阴性结果能让团队大胆放弃。

这就需要稳定的体系,而且鱼的药物暴露要和哺乳动物建立科学联系。


这些问题目前在斑马鱼模型中还没解决。

约70%的人类基因至少存在一个斑马鱼同源基因,大约84%的人类疾病相关基因在斑马鱼里有对应版本。

这支持了它作为疾病研究模型的价值,但并不能直接证明模型好用,因为基因到表型 还隔着蛋白功能、组织表达和生理环境等多层差异。


药企需要针对具体疾病和具体实验终点建立可信的预测关系。

某种心脏表型在鱼里出现后,要能稳定预测后续哺乳动物心脏毒性;某个神经行为终点和人类疾病间有一定的关联。

目前斑马鱼还需要大量数据才能逐渐回答。


再有就是斑马鱼做筛选时,通常把化合物加入水中,让幼鱼浸泡吸收。

这样操作简单,药物消耗也很低。单条幼鱼一次实验需要的化合物量比单只小鼠低两个数量级以上。

但从药理学角度看,水中浓度≠体内浓度。

药物吸收了多少,不同组织的暴露量及游离药物浓度等问题都没办法定量回答。

斑马鱼的药物吸收还受水的酸碱度、缓冲体系和溶解度影响,一些化合物可能在卵黄中富集,进入脑组织的程度也可能有限。


虽然斑马鱼有多种细胞色素P450酶和转运蛋白基因,但它们的活性和组织分布与哺乳动物并不完全一致。

假设两个化合物以相同浓度加到水中,一个有作用,另一个没反应。如果后者只是吸收不足,这个判断就混入了给药方式的影响。

更何况药物的主要形式是口服或静脉注射。

所以斑马鱼要发展出更成熟的药代解释体系。当水中剂量、体内-组织暴露和最终药效关系被建立起来,斑马鱼药物模型才初步合格。

PART 05

标准化也是大问题

学术研究,把模型做稳定就已经足够发表和继续研究。

工业界要求高得多。

同一个实验换一批鱼、换一个操作人员,甚至换一家实验机构,结果都要大差不差。

斑马鱼在这方面还有明显不足,实验条件变化很容易带来重复性问题。

品系、饲料、光照周期、饲养密度,及基因操作和成像方式的细微变化,都能影响最终表型。

看上去像养鱼细节的因素,一旦进入药企体系就是质控问题。这些波动在科研里能接受,但要每天用来筛选和排序候选分子,没人会乐意。

标准化也不只是把操作步骤写成文件。

发育阶段确认,异常个体处理、图像判读等依赖主观的判定都会影响结果。如果关键步骤高度依赖人的经验,交给另一个实验室后需重新摸索,就很难被企业应用。


所以自动化在斑马鱼领域非常重要。不只能提高效率,更重要的是减少人为差异,把依赖经验的实验变成可复制的体系。

未来斑马鱼行业值得关注的是做出标准化数据平台。

从产卵、分选、加药、显微注射、定位到成像,凡是高度依赖人工的步骤,都要实现自动化;在通过高内涵成像外加AI算法可以自动识别鱼体、器官和荧光信号。

PART 06

肿瘤模型的噱头

把患者来源的肿瘤细胞移植到斑马鱼幼体中,形成zebrafish PDX,就是所谓zAvatar,再用不同药物处理,观察肿瘤反应。

幼鱼体型小,每条鱼只需约100~200个肿瘤细胞,几天内就可以得到结果。传统小鼠异种移植需要更多细胞,而且成瘤时间以周甚至月计算。


一项转移性结直肠癌研究中,55名患者对应的斑马鱼模型对化疗敏感性的预测与实际临床反应的一致率达到91%。

这个结果很有吸引力!

幼鱼阶段适应性免疫尚未成熟,因此人源肿瘤细胞能存活和扩增,这对建立快速移植模型是个优势;但同样因为免疫系统不成熟,模型无法复制患者复杂的肿瘤免疫环境。

如果药物机制依赖成熟T细胞、B细胞或更复杂的免疫环境,这种优势马上又变成限制。

所以这类模型不能作为患者病情的替身,顶多是一种快速的活体功能药敏工具,即使如此价值也很大了 !

结语:模型选择最终要回到具体问题

很多人觉得越接近人类的动物就越高级。但决定模型价值的是它能否提现药物相关的生物学机制。

斑马鱼在神经行为研究中可以研究群游、社会偏好等行为,也可以建立类似自闭症相关的表型,但缺乏哺乳动物早期母婴依恋和照护过程;

在代谢领域,斑马鱼的瘦素系统与哺乳动物差异较大,某些肥胖和脂质代谢问题仍然更适合用小鼠研究;

它的心脏和呼吸系统也与哺乳动物明显不同,某些复杂心血管和呼吸系统疾病很难完整复制。

这些限制并不会削弱斑马鱼的价值,反而帮它找到更准确的位置。

监管环境正在给斑马鱼更多空间。

FDA在2025年4月宣布推进减少、改进或潜在替代动物试验的计划,鼓励在IND中纳入替代方案数据;

ICH S5(R3)也允许特定条件下使用合格的非哺乳动物活体实验辅助发育毒性判断。

监管正在改进,但不能据此认定斑马鱼实验已获普遍认可,目前斑马鱼数据在药物申报资料中仍属于支持性数据。

它可以帮助辅助药效毒理信息,也可以在进入昂贵哺乳动物实验前帮助筛选候选分子,但还没到替代哺乳动物模型的程度。

这大概是它今天最真实的位置。

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