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HIV疑似发现“新亚型”,现有抗病毒药物还能控制吗?

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HIV可能又发现一个新亚型,但也能被抑制。

红枫湾APP:日前,法国艾克斯-马赛大学等机构研究团队在《New Microbes and New Infections》发表的一项研究显示,其从一名感染HIV超过30年的女性体内,发现了一种与已知HIV-1亚型存在明显遗传差异的病毒株,可能属于此前尚未发现的新亚型。

研究背景

HIV在不断复制和传播过程中,会发生基因变异,逐渐形成不同的类型和亚型。

目前,HIV-1主要分为M、N、O、P四个组,其中M组是造成全球HIV大流行的主要病毒群体,据信起源于20世纪20年代左右的刚果民主共和国金沙萨地区。

M组内部又分为A、B、C等10个亚型,最近一个得到正式确认的是2020年确认的L亚型,其依据是1983年-2001年间在刚果发现的病毒基因组序列。

要正式确认一个新的HIV亚型,必须满足以下条件:

·至少在3名没有流行病学关联的感染者中,发现具有相同独立进化特征的病毒株;

·与现有亚型存在明显遗传差异;

·不能只是不同亚型之间的基因重组病毒。

研究方法

研究对象是一名60多岁的女性,原籍刚果民主共和国,1989年确诊HIV感染,可能通过当地输血感染。

2023年,研究人员从其血液样本中提取HIV遗传物质,通过多种测序技术获得了一段8950个核苷酸、覆盖约92%参考基因组(B亚型)的病毒序列,缺失部分主要归因于5'端和3'端的测序缺陷。

随后,将其与全球数据库中的已知HIV亚型进行比较,分析病毒基因差异、进化关系及耐药突变等特征。

研究结果

▶发现疑似HIV新亚型,与现有亚型差异明显

研究发现,该病毒株与国际数据库中最接近的10条HIV序列,基因相似度仅为83.29%-83.60%。

进一步比较显示:

·疑似新亚型与10种已知亚型的平均遗传差异为12.69%;

·现有10种亚型之间的平均遗传差异为12.64%。

红枫湾小编:也就是说,该病毒株与现有亚型的遗传差异程度,已经接近不同已知亚型之间的差异水平。

此外,研究人员发现,该病毒株在HIV进化树中形成了独立分支,也未发现明显的亚型间基因重组证据。

因此,研究团队认为,它可能属于一种新的HIV-1亚型,暂时命名为候选M亚型。

▶感染超过30年,现有治疗仍有效

该女性在开始抗病毒治疗时,CD4细胞计数为351个/μL,HIV病毒载量约为10.7万cop/mL。

此后,随着治疗持续进行:

·自2007年以来,CD4细胞计数始终保持在>1000个/μL;

·自2008年以来,病毒载量基本维持检测不到,仅2024年出现过一次低水平可检测结果。

这意味着,即使感染的是遗传差异明显的罕见HIV毒株,现有抗病毒治疗仍可能实现长期病毒抑制。

▶未发现明确的天然耐药突变

研究人员还分析了该病毒株的耐药相关基因,未发现明确的天然耐药突变,但检出了两种既往治疗失败期间获得的耐药相关突变:

·逆转录酶Y181C突变:2003年使用奈韦拉平期间发生治疗失败时检出。

·蛋白酶I84V突变:2007年使用阿扎那韦/利托那韦期间发生治疗失败时检出。

研究人员认为,目前没有证据表明该疑似新亚型天然具有更强的耐药性,但仍需进一步验证。

研究意义

此次发现表明,人类可能尚未完全掌握HIV的遗传多样性,部分地区仍可能存在尚未识别的罕见亚型。

研究人员还观察到显著的样本内多样性,平均宿主内核苷酸差异为1.61%,最高可达5.52%,这表明病毒可能在患者体内不断进化,或者是感染了多种变异株。

不过,目前仅在一名感染者体内发现这一疑似新亚型。按照分类标准,还需要在至少另外两名没有流行病学关联的感染者中发现相应病毒株,才能正式确认。

此外,研究人员通过计算机模拟发现,该病毒株的逆转录酶结构可能与常见亚型不同,但这些变化是否影响病毒复制、传播能力或耐药性,仍需要实验验证。

红枫湾小编:发现疑似HIV新亚型,不代表出现了传染性更强的新病毒,也不意味着现有抗病毒药物失效。此次研究中的女性虽然感染了罕见毒株,但仍能被现有HIV药物抑制。目前更应关注的是:这种疑似新亚型能否得到正式确认、传播范围有多大,以及它是否会影响未来的HIV检测和耐药监测。

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