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Colossal Biosciences周三宣布推出一款名为GenoMorph的新AI平台,用于加速其复活灭绝物种的工作,TechCrunch独家获悉了这一消息。
该平台运用先进的3D形态学、比较基因组学和发育生物学技术,帮助在基因数据有限的情况下识别可用于复活灭绝物种项目的可编辑基因。公司目前正将其应用于复活多多鸟的项目中,该项目可用的基因组数据十分有限。
例如,该公司目前只掌握一个多多鸟基因组,相比之下,在复活毛象项目中,他们已获得100个基因组。公司表示,毛象DNA更为丰富,是因为这种动物生活在寒冷气候中,而寒冷环境更有利于DNA的保存,而多多鸟生活的热带地区则不利于DNA留存。
"通常,科学家可以通过比较多个基因组来了解哪些基因差异导致了某些特征,"Colossal首席执行官兼联合创始人本·拉姆告诉TechCrunch,"但对于古代DNA,我们没有这种优势,因为灭绝物种的DNA本就严重受限,我们只能获得少量完整基因组。"
拉姆表示,为构建GenoMorph,公司收集了大量"鸡、鹌鹑、鸭和鸽子"的发育数据,并结合了"70多种鸟类的基因信息和3D头骨测量数据"。他说,构建这一平台花费了一年多的时间,同时也建立在公司多年灭绝物种复活研究工作的基础之上。
"AI会学习不同鸟类发育喙部和面部结构时,DNA的哪些区域处于活跃状态,并利用这些信息预测可能赋予多多鸟标志性外观的基因开关。"他表示,可以把这个平台想象成多多鸟基因组的"寻宝图",与其在大量潜在基因差异中逐一搜寻,GenoMorph能帮助Colossal团队只锁定真正重要的基因差异。
"目前,我们已经识别出约2300个有希望的多多鸟颅面形态DNA编辑靶点,现在可以在实验室中进行测试,"他继续说道。他表示,GenoMorph将帮助公司解决复活灭绝动物过程中最大的瓶颈之一——找出究竟哪些变化才能真正造就一个灭绝物种的独特性。但拉姆也表示,科学家还需要测试这些编辑能否真正产生所需的生理特征。
"我们开发了一套新系统,利用脂质纳米粒将基因编辑工具直接递送到发育中的鸟类胚胎中,"他说。这将帮助团队观察特定基因变化如何影响鸟类的发育,"而不必等待整个繁育周期,让鸟类达到性成熟。"
该公司周三还宣布,其尼科巴鸽种群现已达到36只,并成功培育出发育为卵子和精子的关键细胞。
"由于尼科巴鸽是多多鸟现存的最近亲属,这些细胞是我们培育出携带多多鸟特征鸟类策略中的关键部分,"他说。接下来,公司希望在实验室中验证GenoMorph的预测结果。"最令人兴奋的是,我们正到达一个节点,我们一直在开发的各种技术开始相互融合,并帮助我们在生命之树完全不同分支上开展的其他项目,"拉姆继续说道。
当被问及以这种方式编辑基因是否安全时,拉姆表示,开发GenoMorph这类技术的目的正是让基因工程"更加精准、可控、可测试"。他说,该产品本身并不进行基因编辑,而是帮助团队识别哪些基因变化值得深入研究。
"识别出一个潜在的编辑点,并不意味着我们会立即将其引入动物体内,或认为它是安全的,"他继续说道,"我们能越精确地识别和验证这些变化,整个过程中做出的决策就越明智。"
与此同时,Colossal Biosciences的最新技术已经获得了XPRIZE创始人彼得·迪亚曼迪斯的信任投票。迪亚曼迪斯是Colossal的投资者,他周三宣布成立了一家新的风投公司NeoGenesis Capital,专门支持利用Colossal Biosciences可编程生物学平台在健康、农业和保护领域开展业务的公司。
Q&A
Q1:GenoMorph是什么?它有什么作用?
A:GenoMorph是Colossal Biosciences推出的AI平台,运用3D形态学、比较基因组学和发育生物学技术,帮助在基因数据有限的情况下识别可用于灭绝物种复活项目的关键基因,目前正用于多多鸟复活项目。
Q2:为什么多多鸟的基因数据比毛象少?
A:因为毛象生活在寒冷气候中,低温环境更有利于DNA保存,而多多鸟生活的热带地区不利于DNA长期留存,导致目前只能获得一个完整的多多鸟基因组,远少于毛象项目中获得的100个基因组。
Q3:GenoMorph能直接编辑基因吗?
A:不能。GenoMorph本身不进行基因编辑,而是帮助科学家识别哪些基因变化值得深入研究和测试,使基因工程过程更加精准、可控和可验证,最终决策仍需经过实验室测试验证。
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