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5亿美元启动虚拟生物学计划,扎克伯格联合MIT、哈佛与英伟达

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导读

AI正在重塑生物学,但最大的瓶颈不是算法,而是数据。

近日,Biohub宣布投入5亿美元启动“虚拟生物学计划”,联合MIT、哈佛、英伟达等全球顶尖机构,旨在构建基于AI的人类细胞预测模型。

该计划将建立开放、标准化的数据基础,打破数据孤岛,推动医学变革。从单细胞到整个人体,这场全球协同的科学实验有望真正实现“模拟生命”,开启精准医学的新时代。

齐萱|编译

01


“虚拟生物学计划”正式启动

4月29日,由普莉希拉·陈(Priscilla Chan)与马克·扎克伯格(Mark Zuckerberg)共同创立的生物医学研究组织 Biohub 宣布,将在未来五年内投入5亿美元,启动“虚拟生物学计划”(Virtual Biology Initiative),旨在为构建基于人工智能的人类细胞预测模型,建立开放、标准化的数据基础。


该计划汇聚了全球顶尖研究机构与企业,包括:麻省理工与哈佛共建的布罗德研究所(Broad Institute)、威康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)、艾伦研究所(Allen Institute)、阿卡研究所(Arc Institute)、英伟达(NVIDIA),以及国际性联盟——人类细胞图谱(Human Cell Atlas)与人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas)。

在首期的5亿美元中,1亿美元将用于资助外部研究,支持全球范围内的协同数据生成工作;其余4亿美元将投入Biohub内部,用于开发下一代成像技术、分子工程工具和数据基础设施。


Biohub联合创始人、陈-扎克伯格倡议联合首席执行官普莉希拉·陈表示:“这是一项重大新承诺,旨在帮助构建生物学下一次飞跃所需的数据基础。”

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AI生物学最大的瓶颈-数据

Biohub科学负责人亚历克斯·里维斯(Alex Rives)指出,当前AI在生物学中的最大瓶颈并非算法而是数据。里维斯表示,“要构建能够准确反映生物学全部复杂性、并加速科学研究的AI,我们需要比现有数据高出几个数量级的规模。我们需要从分子到组织层面、在健康与疾病背景下观察细胞的新技术。”

里维斯曾在EvolutionaryScale担任首席科学家,并在Facebook AI任职研究科学家。他补充道,Biohub 在这一计划中既是“资助者”,也是“建设者”。

该计划并非从零开始,它建立在Biohub已有的大型数据项目之上,包括CELLxGENE、多器官细胞图谱 Tabula Sapiens,以及协调麻省理工、斯坦福、加州大学旧金山分校、哥伦比亚大学和苏黎世联邦理工学院等17个项目的“十亿细胞计划”(Billion Cells Project)。

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全球联盟,各展所长,打破数据孤岛

这一计划覆盖五个国家,各参与机构带来了独特的技术与资源:

布罗德研究所:在单细胞RNA测序和空间转录组学方面处于核心地位。

威康桑格研究所:曾是人类基因组计划的重要贡献者,在疾病基因组学领域领先。

艾伦研究所:提供关键数据集与生物模型。

阿卡研究所:专注于基因组工程与虚拟细胞建模。

英伟达:提供加速计算基础设施、专用软件及技术专家支持。

此外,文艺复兴慈善基金会(Renaissance Philanthropy)也已加入该计划,帮助扩大资助基础。

Biohub方面表示,预计将有更多资助方、研究机构和合作伙伴陆续加入,目前的5亿美元承诺只是一个更宏大全球努力的起点。

布罗德研究所创始主任埃里克·S·兰德(Eric S. Lander)则表示:“完全解读细胞的逻辑是一项巨大挑战,但它有潜力彻底改变医学。这也是一项需要多个团队、多种视角共同协作的挑战。”


国际性联盟人类细胞图谱与人类蛋白质图谱也参与进来。人类细胞图谱目前已拥有来自100多个国家、1700多家机构的3900多名成员,将利用下一代空间组学技术扩展其细胞图谱。总部位于瑞典、自2003年运行至今的人类蛋白质图谱,将为该项目贡献蛋白质组学和成像数据。

斯坦福大学及瑞典皇家理工学院人类蛋白质图谱联合主任艾玛·伦德伯格(Emma Lundberg)指出:“一个全球协调、面向现代AI生物学的数据基础,正是我们打破数据孤岛、加速实现高保真生物学模拟器所需要的。”

值得强调的是,该计划生成的所有数据将向全球科学界公开、免费开放。

普莉希拉·陈则直言:“目前大多数生物学数据是孤岛式的、专有的,而且只用于回答某个特定问题。我们需要的是开放、标准化、供所有人使用并在此基础上继续构建的基础数据集。”

参考资料

Biohub puts $500 million behind AI biology push with MIT, Harvard, and NVIDIA

https://www.edtechinnovationhub.com/news/biohub-puts-500-million-behind-ai-biology-push-with-mit-harvard-and-nvidia


Deep Science预印本



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