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扬州大学胡学运研究组揭示PPR蛋白EMB1417参与叶绿体RNA加工新功能

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近日,扬州大学胡学运教授研究组在植物学著名期刊Journal of Experimental Botany在线发表了题为The pentatricopeptide repeat protein EMB1417 is required for chloroplast RNA editing and intron splicing in Arabidopsis的研究论文。该研究阐明,叶绿体蛋白EMB1417通过与编辑因子MORFs/DG409及剪切因子CFM3相互作用,介导RNA加工过程,从而在叶绿体发育中发挥关键作用。


PPR蛋白是植物体内规模最大的RNA结合蛋白家族之一,在线粒体与叶绿体的RNA转录过程中扮演着关键角色。此前已有研究证实,PPR家族成员EMB1417通过与WTF1、CRS2蛋白相互作用,参与叶绿体ycf3.2和rpoC1基因内含子的剪切。该研究发现:前人采用CRISPR–Cas9基因编辑技术创制的EMB1417功能缺陷的突变体仍保留一定的功能,因而通过研究这样的突变体有可能不能完全揭示该蛋白的功能。为进一步解析EMB1417的生物学功能,该研究团队在拟南芥中创制了EMB1417的雌二醇诱导型RNAi株系,当诱导EMB1417基因沉默后,植株新生叶片表现出明显的黄化表型。


图1:诱导型EMB1417-RNAi株系的表型

进一步的分析发现,EMB1417-RNAi不仅影响ycf3.2和rpoC1内含子的剪切,还显著影响petB和 petD内含子的剪接。出乎意料的是,EMB1417-RNAi 还影响accD-1568、petL-5、 psbZ-50、clpP-599和ndhD-2 等5个RNA位点的编辑。

随后该研究利用酵母双杂交(Y2H),双分子荧光互补(BiFC)和Pull-down等实验筛选并验证了EMB1417与RNA编辑因子MORFs和DG409互作介导叶绿体内RNA编辑。此外,其还与剪切因子CFM3相互作用参与叶绿体内含子剪接。综上所述,该研究在前人的基础之上,进一步揭示了EMB1417通过与编辑因子MORFs和DG409以及剪切因子CFM3互作既参与叶绿体RNA编辑,又参与叶绿体RNA剪接的角色。进一步完善了EMB1417的分子功能,为叶绿体RNA加工机制提供了新的见解。


图2:拟南芥EMB1417参与叶绿体RNA加工的工作模型

扬州大学生物科学与技术学院在读博士研究生曾楚为该论文的第一作者,胡学运教授、农业科技发展研究院的贾婷助理研究员,青年教师焦青松博士为该论文的通讯作者。扬大生科院已毕业研究生武烔桧和在读博士生苏金玲参与了部分工作。该研究得到了国家自然科学基金的资助。

https://doi.org/10.1093/jxb/erag362

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