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聚焦作物多组学国际合作,第三届植物时空组学国际研讨会在珀斯成功举办

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9月13日至16日,第三届植物时空组学国际研讨会(STOC Plant 2026)在澳大利亚珀斯举行。大会由澳大利亚莫道克大学、基因组多维解析技术全国重点实验室和植物时空组学联盟(STOC Plant)共同主办,华大研究院、Molecular Plant和Plant Communications共同承办,华大集团、华大智造、澳大利亚阿德莱德大学及GigaScience协办。

本届大会以“从图谱到行动:以植物多组学赋能作物改良(From Atlas to Action: Empowering Crop Improvement with Plant Multi Omics)”为主题,吸引来自10个国家的植物科学、基因组学、人工智能等领域的200余名代表参会,聚焦植物时空多组学从图谱构建走向作物性状解析、预测模型和育种应用的研究进展与合作路径。

会议期间,大麦时空组学联盟正式成立,于STOC Plant 2025期间发起的小麦时空组学联盟则进一步推进下一阶段合作,为国际团队共享研究资源、联合开展作物多组学研究及推动育种应用提供了新的合作契机。


大会现场

汇聚多方力量,推动组学创新走向农业应用

9月13日,大会执行主席、澳洲科学院院士、澳大利亚莫道克大学作物与食品创新中心及西澳州农业生物技术中心主任Rajeev Varshney教授致欢迎辞。他指出,先进组学技术在提升植物研究分辨率的同时,还需进一步降低成本和应用门槛,使更多实验室、育种工作者和种植者从中受益。


Rajeev Varshney院士主持会议

大会主席、中国科学院院士杨维才通过视频致辞,阐释“从图谱到行动”的大会主题。他指出,多组学、成像和人工智能正在推动植物发育与环境响应高分辨率图谱的构建,下一阶段需要进一步识别影响作物性状的关键细胞状态和调控机制,并通过遗传学、表型和育种研究验证其应用价值。

澳大利亚莫道克大学校长Andrew Deeks教授、西澳大利亚州议会议员Parwinder Kaur、莫道克大学研究与创新副校长Peter Eastwood教授分别致辞,围绕气候变化背景下的农业挑战、跨学科创新、粮食安全及科研成果转化等议题分享观点。Peter Eastwood教授还介绍了小麦时空组学国际合作进展,强调跨机构协作对推动科研成果服务农业可持续发展的重要性。

澳大利亚谷物研发公司(GRDC)遗传技术高级经理Jessica Hyles博士、西澳大利亚州第一产业与区域发展部大田作物系统执行主任Kaara Klepper博士及中国驻澳大利亚大使馆公使衔参赞(科技)王凌分别从科研资助、农业生产和国际合作角度发言,强调数据标准与共享、细胞机制与田间表现衔接以及中澳农业科技合作。

开幕式后,大会主席、基因组多维解析技术全国重点实验室主任徐讯研究员与澳大利亚莫道克大学校长Andrew Deeks教授分别代表双方签署华大与莫道克大学合作备忘录,进一步深化双方在科研创新、人才交流和平台建设等方面的合作。


合作备忘录签署

从图谱构建走向性状解析与育种应用

大会设置四场主旨报告,围绕植物功能基因组学、时空多组学、人工智能、预测模型和作物改良展开交流。

大会主席、基因组多维解析技术全国重点实验室主任徐讯研究员提出,植物时空多组学研究应从定位细胞状态进一步走向机制解析和性状预测。他结合水稻全生命周期图谱、豆科根瘤空间互作及作物基础模型研究,强调通过标准化多模态数据、模型构建和实验验证,推动植物图谱向作物性状解析与育种应用转化。


徐讯研究员作主旨报告

澳大利亚西澳大利亚大学Ian Small教授围绕植物核基因组、叶绿体基因组和线粒体基因组的协同作用展开报告,探讨细胞器基因表达、叶绿体工程和小麦细胞质雄性不育等研究在解析农艺性状、杂交育种和作物改良中的应用。


Ian Small教授作主旨报告

澳大利亚莫道克大学Rajeev Varshney教授围绕作物遗传多样性和环境适应展开报告,介绍利用高质量基因组、泛基因组、群体测序和功能验证发掘重要性状相关基因的研究框架,强调将基因发现与多环境验证、育种项目和产业需求相衔接。


Rajeev Varshney教授作主旨报告

澳大利亚昆士兰大学Robert Henry教授围绕空间食物组学与谷物、果实品质研究作主旨报告,介绍空间转录组结合长读长测序,可解析小麦种子组织的表达分区。以磨粉产量和碳回收为例,他说明空间信息有助于定位品质与抗逆机制,并可拓展至果实品质调控和甘蔗生物质利用,为精准育种和食品创新提供支撑。


Robert Henry教授作主旨报告

大麦时空组学联盟正式成立

9月15日,大麦时空组学联盟(Barley Spatial Omics Consortium)在STOC Plant 2026上正式成立。这是继小麦时空组学联盟之后,由STOC Plant推动成立的第二个作物专项联盟。

联盟主要发起人之一、澳洲工程院院士、澳大利亚莫道克大学李承道教授在启动仪式上致辞并介绍联盟愿景。他回顾了国际大麦研究团队在基因组和泛基因组研究方面的长期合作,指出单细胞、空间组学及多组学技术的快速发展,为解析大麦复杂性状并推动科研成果服务育种和产业提供了新的契机。


大麦时空联盟成立仪式

大麦时空组学联盟由李承道教授、徐讯研究员等专家共同发起。联盟将持续面向国际大麦研究团队开放,依托已有的大麦基因组和泛基因组资源,汇聚遗传学、时空组学、功能基因组学、作物育种和数据科学等领域的研究力量,推动跨机构、跨学科国际合作。

启动仪式汇聚了来自澳大利亚莫道克大学、基因组多维解析技术全国重点实验室、澳大利亚昆士兰大学、澳大利亚塔斯马尼亚大学、德国慕尼黑亥姆霍兹中心、澳大利亚阿德莱德大学、浙江大学、崖州湾国家实验室及西澳大利亚州第一产业与区域发展部等机构的代表。

联盟将围绕大麦关键发育阶段、重要农艺性状和环境适应开展合作,促进生物材料、技术方法、数据标准和分析工具的共享。相关研究将重点关注如何利用空间组学等技术解析大麦产量、籽粒与麦芽品质及逆境适应的细胞和分子基础,并推动研究成果向育种、生产和加工应用转化。

小麦时空组学联盟推进下一阶段合作

小麦时空组学联盟(WSOC)目前已汇聚来自9个国家、30家机构的80名研究人员。本届大会期间,联盟举行闭门会议,围绕如何从时空图谱构建走向作物性状发现、预测模型和育种应用展开讨论。

联盟目前设有八个工作组,研究方向涵盖营养器官与穗部发育、种子品质、干旱和高温等逆境响应、小麦—微生物互作、基因编辑效率提升以及数据标准化。会议进一步讨论了实验流程标准化、跨机构数据共享、AI-Ready数据标准及小麦泛基因组计划。

WSOC将继续深化广泛国际合作,将单细胞和空间图谱与遗传变异、环境数据、田间表型及育种计划相结合,形成从分子机制解析到田间育种决策的完整研究链条。


小麦时空联盟研讨会

凝聚作物多组学研究共识

大会设置植物组学技术圆桌论坛及豆科与大豆、其他谷类、小麦、园艺作物四场平行专题研讨会,涵盖基因组与泛基因组、单细胞和空间组学、结构变异、植物—微生物互作、预测育种和多环境验证等方向。

在“面向植物生物学的组学技术”圆桌论坛中,华大智造高级副总裁刘心与参会专家共同认为,多组学研究应进一步加强数据标准化、开放共享和跨平台复用。人工智能可支持多源数据整合与预测建模,但仍需结合生物学解析和田间验证,推动细胞尺度机制与基因型、环境和农艺性状相衔接。


圆桌论坛

在“组学技术赋能植物育种”圆桌论坛中,专家结合苹果、园艺作物、菜豆和油菜等案例指出,组学技术的价值最终应体现为更优的育种决策、更短的育种周期和更高的遗传增益。预测准确性并不等同于育种成效,合理的杂交配组、低成本筛选工具和持续的田间验证同样关键。当前,成本、数据可及性和复合型人才仍是技术推广的主要挑战;单细胞和空间组学则主要服务于机制解析、候选基因发现和分子标记开发。

大麦时空组学联盟的成立和小麦时空组学联盟的持续推进,为国际团队共享数据、材料和技术经验提供了协作平台,将促进作物时空多组学从资源建设走向机制发现、性状预测和育种应用。华大智造作为大会核心战略合作伙伴,持续支持植物时空组学国际交流及中澳科研合作。

作为STOC Plant 2026的核心战略合作伙伴,华大智造深度参与大会组织并提供重要支持,持续推动植物时空组学国际学术交流以及中澳科研合作与平台共建。


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