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见微知著AI制药管线,事实说明一切!

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各种AI大模型、上亿融资、BD新闻刷屏,MNC在用钱投票,闹得不亦热乎~今天的 AI制药 已不是能不能行的问题,而是谁先跑到终点!

但很多人心里还是打鼓: AI找到分子、靶点,到底能不能成药?

这不能靠理论回答,得看具体东西。

今天这篇胖猫选了眼下最受捧的AI药物管线,从早期靶点发现,到临床II期、III期数据,看看啥情况。

见微知著,通过这几条管线感知这波AI制药浪潮到底是真命题还是一阵风!

01

Zasocitinib,即将冲线上市

Nimbus Therapeutics加Schrödinger再加武田上演了AI技术的三英战吕布!用到的AI技术是大规模自由能扰动(Free Energy Perturbation, FEP+)

管线设计逻辑基于计算化学,同时加上AI加速的苗头化合物优化。


靶点就是我们耳熟能详的。

JAK家族四个激酶TYK2、、JAK2和JAK3的催化域结构高度相似,激酶抑制的选择性是个大难题。

Nimbus和Schrödinger用大规模基于物理的模拟(特别是FEP+)克服了JAK家族内序列相似性带来的选择性挑战。

先用FEP+预测药物TYK2的靶向活性及对JAK2和JAK3的脱靶活性。再引入绝对FEP+预测水溶性,在建模早期解决ADME问题。

团队对预筛的4000个候选分子进行了大规模FEP+评分,评估其效力、选择性和溶解度,并将FEP+部署到云计算资源。

最终,基于FEP+计算,46个分子被优先合成,其中9个在实验测试中符合标准。最终开发出一种靶向TYK2 JH1结构域的候选药物,该药物对JAK2具有高度选择性,对JAK1和JAK3具有中等选择性。


团队用AI辅助的分子设计引擎快速生成、评估、淘汰庞大的虚拟化合物库,主要技术指标有三项: 1)皮摩尔级亲和力; 2)对JAK1/2/3几乎无选择性; 3)良好的溶解性;

在传统药化解决方案下要满足三者需要数年时间,但FEP+把这个时间压缩到了数月。


从临床结果看,Zasocitinib治疗中重度斑块状银屑病成人患者的两项关键性III期随机、多中心、双盲、安慰剂和活性对照研究取得了积极的顶线结果。


值得一提的是,这个产品早就被武田以40亿首付款买走了!

对的,你没看错,算是几年来说,Big pharma BD交易,首付款金额之最了!

02

GB-0895,生成式AI设计的抗体

Generate Biomedicines的自研生成式编程生物学平台

传统抗体筛选靠的是噬菌体展示或杂交瘤技术,从抗体库里捞序列。


Generate从临床的问题出发,AI直接生成目标抗体序列。 平台运行逻辑是一个闭环:生成(Generate)→ 构建(Build)→ 测量(Measure)→ 学习(Learn)。


GB-0895是靶向TSLP的抗体。

通过AI锁定表位,选择合适亲和力抗体。AI识别的恰好是TSLP与受体结合的关键区域,阻止信号传导的效率远超传统抗体。

再通过AI预测Fc区改造方案,延长抗体体内的循环时间,实现半年给药一次。



03

Zovegalisib,基于蛋白运动轨迹的别构抑制剂

Relay Therapeutics利用分子动态学 + 低温电子显微镜 + 变构口袋发现

Relay的技术哲学很独特,蛋白质不是静态的,它们在持续运动。


他们用Cryo-EM解析了PI3Kα全长结构,包括野生和多种突变体型(H1047X、E542X、E545X)。

通过分子动态模拟发现了传统X射线晶体学从未揭示的隐性变构口袋,这个口袋 只在突变体 蛋白运动过程中短暂出现,野生型则几乎没有。

这就是Zovegalisib的设计出发点,不去抢ATP结合位(那是所有已上市PI3K抑制剂的战场),而是打突变体专属变构口袋。

结果显示RLY-2608对突变PI3Kα的抑制活性比野生型高出数十倍,实现了真正的选择性打击,正常细胞几乎不受影响。

绕开了传统PI3K抑制剂的血糖紊乱等严重副作用。

从临床结果看, Zovegalisib在PI3Kα突变驱动的乳腺癌和血管畸形中疗效显著优于现有标准治疗,有潜力成为这些适应症的BIC(Best-in-Class)药物。

2026年底将有多项注册里程碑,2027年初启动一线乳腺癌关键试验。


04

REC-4881,AI表型筛选 + 基因-疾病关联预测

Recursion(Morphology DevMap、MapData)的高通量细胞形态学图谱(Morphological Phenotyping)+ 因果推理模型

Recursion与其它AI制药公司不同,核心平台是形态学图谱。

用显微镜对数百万个细胞进行成像,每个细胞提取一千多种形态特征(细胞核面积、线粒体形状、突触分布……),建立正常细胞与疾病模型细胞的视觉指纹库。


对REC-4881,Recursion建立了APC基因敲低的疾病模型。

APC突变是家族性腺瘤性息肉病FAP的致病原因,患者肠道细胞失去了调控β-catenin降解的能力,导致Wnt通路持续激活,息肉疯狂生长。


AI在数千个化合物库中筛选哪一个分子能让APC突变细胞的形态回归正常,最终发现MEK1/2抑制剂有这个效果!

这是一个完全由AI预测驱动发现的靶点。

随后Recursion用因果推理模型深入研究MEK抑制→下游通路下调→β-catenin信号正常化→息肉减少。解释了REC-4881在FAP患者中产生效果的底层机制。


所以REC-4881的创新不在分子本身(这产品从武田license in的),而在于AI找到了它在FAP适应症上的新用途,实现了老药新用+精准匹配。

REC-4881目前处于Phase 1b/2, 安全性上不良事件多为 1/2 级(痤疮样皮炎、CPK 升高、皮疹),3 级发生率低,无 4/5 级,安全性可控。

有效性方面 ,4 mg组给药 12 周后大多患者息肉明显减少,停药12周后仍维持效果。


05

总结

这几家公司最快的是Zasocitinib(武田/Nimbus),其次是GB-0895和Zovegalisib的III期管线。

见微知著,背后是十几家公司的不同解题思路。技术路线没有绝对优劣,靶点、分子、资金、执行,缺一不可。


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