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Pfizer总结在JMC最新发文 | 药物化学家必备的全套实用结晶指南,告别柱层析!

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药物合成放大过程中,样品需要从毫克级快速放大,反复过柱会耗费大量时间、原料。通过直接滴加结晶(direct‑drop crystallization),同时覆盖重浆、重结晶纯化方式,利用反溶剂调节溶解度,从反应粗液直接分离产物,减少柱层析依赖,实现药物分子快速放大制备。


直接滴加结晶

不做传统萃取后处理,直接在粗反应混合液中通过反溶剂诱导产物结晶析出。若结晶失败,反应体系不会被破坏,样品依旧可以回到常规萃取‑过柱流程,仅消耗少量时间。

优势:快速分离产物;结晶固体纯度往往优于柱层析;小试结果直接预判放大可行性;失败不破坏样品。


基础条件:①产物常温状态是固体(析出固体≠得到晶体);②产物室温在至少一种溶剂中溶解度有限,溶解度小于 10 mg/mL。


溶解度相图

体系分为不饱和区、饱和、过饱和区。升温提高溶解度,降温制造过饱和引发成核结晶。实验室易缺少控温设备,加入反溶剂是更实用制造过饱和的手段。


六大直接滴加结晶实操路径

根据反应溶剂是否和水互溶,划分两大类体系。水互溶溶剂包含乙腈、DMF、DMSO、THF、甲醇、丙酮,水不互溶溶剂包含乙酸乙酯、甲基叔丁基醚、甲苯、2‑MeTHF 等。

水可互溶溶剂

其中,Aq 是将反应混合物加入H2O,i-Aq是将H2O加入反应混合物。

Aq 路径

将反应液滴入H2O。小试取 2 mL H2O搅拌,把粗反应液以 0.1 mL 梯度逐步滴入H2O中。一旦出现油层、凝胶、乳化现象,该路径无法进行。若产生固体浆料,过滤,使用 80:20 水‑有机混合溶剂洗涤,用 LCMS 同时检测固体与母液纯度。

优缺点:该方法操作快,但是瞬间产生极高过饱和度,很容易出油,成功率偏低。


i‑Aq 反相水路径

把H2O滴入反应液。取 0.5 mL 粗反应液搅拌,逐滴滴加H2O,密切观察浊点。滴加累计 1 mL H2O仍然无固体析出,代表 Aq/i‑Aq 两条基础路径基本无法进行,直接走常规萃取。若看到浊点立刻停止加水,浆料老化 1‑2 分钟,继续补加水至 2 mL,过滤洗涤,检测固体、母液纯度。

优点:相比 Aq 路径,反相加反溶剂过饱和生成更加平缓,可控性更好。


水可互溶溶剂进阶方法

如果 Aq、i‑Aq 全部失败,但该反应需要反复放大,柱层析代价过高,就进行 Blend 系列流程。

Blend 流程

①解析粗反应体系;

②简化反应液:过滤除去不溶固体,浓缩体系至小于 20 V,蒸馏去除低沸点溶剂、挥发性有机碱,调节 pH;

③调节反应温度:制备三份简化后反应液,分别为 0oC低温、室温、50oC高温;同步配置对应温度的纯水、1:1 水‑乙腈混合储备液;


④三份反应液先在 Aq/i‑Aq 测试,不成功再进行 Blend(反应液滴入 1:1 水‑有机溶剂混合液)与 i‑Blend(1:1 混合溶剂滴入反应液)。采用 1:1 水‑有机混合溶剂替代,能够缓和过饱和程度,减少出油凝胶问题,同时配合冷热温度调节产物溶解度。如果全部路径均失败,可进一步采用晶种结晶等方式。


水不互溶溶剂

首选,明确目标产物是固体。进行操作前,第一步必须先做水相后处理,除去无机盐与水溶性杂质,有机相充分干燥,残留水分会严重抑制结晶。

Org 路径

与 Aq 的流程类似,将粗有机反应液梯度滴入多种反溶剂(庚烷、甲苯、MTBE 等)。每个反溶剂条件中加入 2.0 mL反溶剂,再按 0.1 mL 的增量逐步加入反应液,直到累计加入 0.5 mL反应液。形成固体浆料后进行过滤、洗涤和纯度检测。


i‑Org 路径

将各类反溶剂逐滴滴加到反应液内部,按每次 0.1 mL 逐滴加入反溶剂。看到浊点立刻停止加反溶剂,浆料老化 1‑2 分钟,继续补加反溶剂至 2 mL,过滤洗涤,检测固体、母液纯度。


结晶固体的进一步纯化

重浆与重结晶

若直接滴加结晶拿到的固体纯度达不到要求,优先使用重浆、重结晶替代柱层析。

重浆(reslurry)

固体不完全溶解,溶剂浸泡搅拌后过滤。

优缺点:物料消耗少、不容易出油,适合高通量小试筛选。但不一定可以完全清除所有杂质,适合拿到够用纯度产物继续推进下游。

重结晶(recrystallization)

固体全部溶解,再降温析出晶体。

优缺点:除杂能力强,晶型控制效果好。但物料消耗大,易发生油析粘壁,部分体系需要晶种诱导,适合需要极高纯度的样品。


溶剂快速筛选技巧

根据反相 LCMS 色谱保留时间,把杂质、产物分为极性(水易溶)、中等极性、非极性(有机溶剂易溶)三类。根据杂质极性来挑选重浆溶剂,定向让杂质溶解进入母液,目标产物依旧保持固体。


使用 14 种纯溶剂和 4 种水/有机溶剂混合体系,筛选出效果最优的溶剂条件放大。候选溶剂包含甲醇、异丙醇、乙腈、乙酸乙酯、MTBE、甲苯、庚烷、水以及各类水‑有机混合体系。


正式重结晶

①逐步升温测定澄清点,温度高于澄清点 5‑10oC,保证样品全部溶解;

②分步降温,每次下降 5‑10oC,在亚稳区间(metastable zone)停留数分钟,等待自发成核;

③肉眼刚看到固体(浊点),进行老化,继续分步降温至室温,过滤洗涤。


应用实例

酚类底物的溴代反应(i‑Aq 路径)

小试测试,经 i‑Aq 路径,水滴加入反应液实现可控结晶,体积比例可以直接平移放大。

100 g 规模:进行小幅优化,析晶完成后浆料冷却至 10 oC长时间老化再过滤,最终收率 74%,纯度 98%,全程不用柱层析。


硝化‑SNAr 串联反应(Blend 路径)

反应规模大于 5 g 后,柱层析很难除去环丁砜。除去不溶碳酸钾后经 Blend 流程,筛选得到 2:1 水‑乙腈作为反溶剂混合液,后续补加水进一步压低溶解度。

12 g 规模:55% 收率得到 97% 纯度结晶固体。虽整体体系体积偏大,不适合长期工业化,但完全规避柱层析,满足早期项目快速放大。



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