聚焦肠道噬菌体！中山六院左涛课题组Cell Host & Microbe两连发

肠道里住着一种叫“噬菌体”的病毒，它是肠道病毒群中的重要成员，在人体健康和疾病中扮演了目前尚未被深入解析的功效。近日，我院左涛研究员团队在肠道噬菌体/病毒组领域取得重要进展，两篇相关文章先后发表在Cell子刊Cell Host & Microbe（IF:18.7）。一篇阐释了肠道噬菌体在炎症性肠病（IBD）中的作用机制，另一篇揭示了抗病毒药物对人体共生病毒组（包括噬菌体）的潜在影响。这些发现为理解肠道噬菌体/病毒组与宿主健康的关系提供了全新视角。

噬菌体“肠型”决定克罗恩病炎症异质性

2026年3月，左涛团队于Cell Host & Microbe发表研究论文“Gut DNA virome enterotype dictates inflammation heterogeneity through tuning the phage-bacteria-sphingosine-intestine axis in Crohn’s disease并被Cell HostMicrobe选为亮点文章（Featured Article），同时有专家同期述评 (Preview)。该研究聚焦一个长期被忽视的核心问题：肠道噬菌体如何影响IBD肠炎异质性？

克罗恩病（Crohn's disease, CD）是一种常见的炎症性肠病（IBD）。其发病涉及遗传因素、环境影响和肠道微生物失调等多重因素。以往研究多聚焦于肠道细菌的作用，却忽略了数量远超细菌的噬菌体。噬菌体作为专门感染细菌的病毒，堪称肠道生态系统的“调节大师”。它们如何影响克罗恩病的炎症差异以及背后的机制，仍是医学领域的未解之谜。

研究团队收集了克罗恩病患者和健康人的肠道黏膜和粪便样本，进行噬菌体测序、基因和代谢物分析。结果发现，人类噬菌体群可分为两种截然不同的“肠型”：E1型与E2型。其中E2型相关噬菌体Wulfhauvirus在克罗恩病患者中显著富集，提示其可能与肠道炎症加重相关。进一步的研究表明，E2型噬菌体群相比E1型具有更强的促炎作用。机制上，E2中分离得到的新型温和性噬菌体øBTZT001P（属于Wulfhauvirus）通过溶原方式感染多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron），增强其鞘氨醇（sphingosine）合成分泌，进而抑制共生菌Blautia obeum的生长，导致肠道菌群失衡并加剧肠道炎症。该研究揭示了肠道噬菌体群组成差异可通过“噬菌体-细菌-代谢物-肠道”轴影响克罗恩病结局，强调了肠道噬菌体与细菌之间的“跨界互动”在维持肠道稳态及克罗恩病发生发展中的重要作用。

专家同期述评 (Preview)

抗病毒药物治疗的另一面

——它会“误伤”我们的共生病毒吗？

继左涛被Nature Reviews MicrobiologyNature Reviews Gastroenterology & Hepaotology （*2）、Lancet Gastroenterology & Hepatology邀稿撰写肠道病毒组文章后，今年5月，他再次受邀于Cell Host & Microbe发表文章“Potential impacts of antivirals on the virome”，聚焦一个长期被忽视的核心问题：抗病毒药物是否会对人体内共存的共生病毒产生影响？

抗病毒药物是全球应用最广泛的抗感染手段之一，对治疗流感、肝炎、HIV等疾病至关重要。然而，这类药物在攻击病原病毒的同时，是否会影响人体内那些共存的“无害病毒”？人体内的共生病毒组通过与免疫系统、细菌群落的互动，参与维持健康稳态。遗憾的是，抗病毒治疗对这一生态系统的潜在影响长期被忽视。针对这一问题，本文首次系统阐述，填补了该领域的概念空白。

抗病毒药物可能通过两种方式重塑共生病毒组。一是直接作用：不同病毒在结构上存在相似性，药物可能对非靶向的共生病毒产生交叉反应。二是间接作用：药物通过调控宿主免疫或重塑细菌群落，引发“级联反应”，间接改变病毒组的组成与活性。论文首次构建了“抗病毒药物—共生病毒组”双向互作的理论框架，超越传统仅关注靶病毒的视角，揭示了病毒组从“被动背景”向“主动调节因子”的角色转变。

当前，抗病毒药物如何影响共生病毒组的研究仍处于起步阶段，现有证据多为相关性探索，缺乏系统性的因果解析。未来亟需开展机制导向的系统性研究，以解析二者之间的复杂互动关系。左涛团队为这一新兴方向提供了系统化的概念基础与理论起点，有望推动抗病毒策略从“单一杀灭”向“生态调控”的范式转变，为更精准的抗病毒治疗和微生态稳态管理开辟新路。

左涛团队合照

专家介绍

左涛研究员

国家高层次青年人才，中山大学胃肠病学研究所副所长，中山大学人体微生态与慢病教育部重点实验室常务副主任，中山大学“百人计划”中青年杰出人才。WHO药物对肠道微生态健康工作组专家（全球6位），入选全球前2%顶尖科学家，获得美国消化病学会(AGA)颁发的“青年研究奖”（连续2次）、Elsevier中国高被引学者、世界微生物科普倡议组 (IMiLI) 成员、香港中文大学研究计划fellowship、欧洲克罗恩病与结肠炎委员会（ECCO）青年委员、国际微生物病毒协会（ISVM）会员、美国微生物学会（ASM）会员、中国微生物学会微生态专委会委员、中国生物物理学会肠道菌群分会委员、中国微生物学会益生菌专委会委员、中国人体健康科技促进会肠道微生态与菌群移植专业委员会常务委员、中国医药教育协会微生态与健康专业委员会委员、广东省精准医学应用学会微生态医学分会委员、广东省精准医学应用学会长青智库工作委员会委员。以最后通讯作者发表Cell Host & Microbe (3)、Cell Metabolism(1)、Nature Metabolism (2)、Lancet Gastroenterology & Hepatology (1)、Lancet Microbe(2)、Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology (2)、Nature Reviews Microbiology (1)、Nature Reviews Bioengineering (1)、Gut (2)、Microbiome (1)、Nature Communications (1)、Gut Microbes (1)、Journal of Medical Virology (1)等。

责任编辑：刘山青

初审：张源泉

审核：乐虞莹、吕竹

终审：李文敏

审定发布：龙波